Kegiatan Ekstrakulikuler yang ada di SMAN 40 Jakarta yaitu:
- Kerohanian Islam
- Kerohanian Kristen
- Bola Basket
- Bola Volly
- Bulu Tangkis
- Tenis Meja
- Marching Band
- Futsal
- Kelompok Ilmiah Remaja (KIR)
- Merpati Putih
- Modern Dance
- K-pop Dance
- Paskibra
- Paduan Suara dan Angklung
- Palang Merah Remaja (PMR)
- Patroli Keamanan Sekolah (PKS)
- Pusat Dokumentasi dan Informasi (Mading/Majalah Sekolah)
- Karate
- Taekwondo Dechin Club
- Teater
- English Club